Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms