Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms