Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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