Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms