Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NDRG3Q9UGV2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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