Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms