Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms