Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms