Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms