Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms