Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms