Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SAMD8Q96LT4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SAMD8Q96LT4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SAMD8Q96LT4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SAMD8Q96LT4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SAMD8Q96LT4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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