Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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