Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms