Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT27Q7Z3Y8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms