Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBE3BQ7Z3V4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms