Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms