Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR3Q6ZT12 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms