Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms