Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms