Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM69BQ5VUD6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM69BQ5VUD6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms