Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms