Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf21Q32NC0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms