Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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