Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms