Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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CRY1Q16526 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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CRY1Q16526 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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CRY1Q16526 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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CRY1Q16526 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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CRY1Q16526 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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CRY1Q16526 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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CRY1Q16526 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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CRY1Q16526 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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