Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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SS18Q15532 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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SS18Q15532 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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SS18Q15532 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SS18Q15532 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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