Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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