Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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TUBB3Q13509 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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TUBB3Q13509 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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TUBB3Q13509 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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TUBB3Q13509 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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TUBB3Q13509 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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