Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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