Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms