Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RELAQ04206 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RELAQ04206 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RELAQ04206 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RELAQ04206 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RELAQ04206 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RELAQ04206 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RELAQ04206 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RELAQ04206 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RELAQ04206 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RELAQ04206 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RELAQ04206 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RELAQ04206 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RELAQ04206 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RELAQ04206 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RELAQ04206 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RELAQ04206 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RELAQ04206 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RELAQ04206 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RELAQ04206 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RELAQ04206 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RELAQ04206 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms