Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC097478.3-201ENST00000620420 872 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 TMEM92-AS1-201ENST00000508851 750 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms