Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD1P98174 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD1P98174 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD1P98174 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD1P98174 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD1P98174 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD1P98174 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD1P98174 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD1P98174 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD1P98174 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD1P98174 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD1P98174 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD1P98174 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD1P98174 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD1P98174 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD1P98174 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms