Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms