Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA52P62987 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBA52P62987 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA52P62987 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA52P62987 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA52P62987 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA52P62987 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA52P62987 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA52P62987 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA52P62987 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA52P62987 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA52P62987 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA52P62987 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms