Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABP4P57796 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABP4P57796 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABP4P57796 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CABP4P57796 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CABP4P57796 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABP4P57796 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABP4P57796 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABP4P57796 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABP4P57796 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABP4P57796 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABP4P57796 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABP4P57796 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABP4P57796 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABP4P57796 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABP4P57796 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABP4P57796 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABP4P57796 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABP4P57796 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABP4P57796 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABP4P57796 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABP4P57796 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABP4P57796 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CABP4P57796 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABP4P57796 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABP4P57796 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABP4P57796 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABP4P57796 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABP4P57796 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms