Protein–RNA interactions for Protein: P51164

ATP4B, Potassium-transporting ATPase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4BP51164 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4BP51164 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4BP51164 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4BP51164 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4BP51164 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4BP51164 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4BP51164 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4BP51164 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4BP51164 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4BP51164 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4BP51164 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4BP51164 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4BP51164 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4BP51164 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4BP51164 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4BP51164 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4BP51164 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4BP51164 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4BP51164 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4BP51164 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4BP51164 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4BP51164 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms