Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms