Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms