Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms