Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPOP42166 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPOP42166 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPOP42166 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMPOP42166 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMPOP42166 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMPOP42166 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMPOP42166 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMPOP42166 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMPOP42166 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPOP42166 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPOP42166 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPOP42166 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPOP42166 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPOP42166 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPOP42166 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPOP42166 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPOP42166 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPOP42166 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPOP42166 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPOP42166 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPOP42166 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPOP42166 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPOP42166 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPOP42166 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPOP42166 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPOP42166 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPOP42166 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPOP42166 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPOP42166 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPOP42166 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms