Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms