Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms