Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI3P10071 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI3P10071 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI3P10071 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI3P10071 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI3P10071 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI3P10071 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI3P10071 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI3P10071 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI3P10071 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI3P10071 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI3P10071 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI3P10071 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI3P10071 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI3P10071 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI3P10071 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI3P10071 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI3P10071 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI3P10071 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI3P10071 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI3P10071 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI3P10071 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI3P10071 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI3P10071 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI3P10071 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI3P10071 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI3P10071 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI3P10071 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI3P10071 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI3P10071 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI3P10071 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI3P10071 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI3P10071 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI3P10071 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI3P10071 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GLI3P10071 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GLI3P10071 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GLI3P10071 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GLI3P10071 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GLI3P10071 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GLI3P10071 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GLI3P10071 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GLI3P10071 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI3P10071 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI3P10071 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI3P10071 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI3P10071 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI3P10071 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI3P10071 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI3P10071 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms