Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC175P0C221 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms