Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms