Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GMDSO60547 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms