Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBDO15205 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBDO15205 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBDO15205 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBDO15205 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBDO15205 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBDO15205 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBDO15205 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBDO15205 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBDO15205 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBDO15205 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBDO15205 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBDO15205 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBDO15205 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBDO15205 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBDO15205 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBDO15205 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBDO15205 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms