Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASKO14936 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASKO14936 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms